biologia molekularna krótkie wykłady sekcja D

 0    127 フィッシュ    aleksanderwieckowski
mp3をダウンロードする 印刷 遊びます 自分をチェック
 
質問 język polski 答え język polski
escherichia coli jaki ma genom
学び始める
genom prokariotyczny
jak wygląda DNA E. coli
学び始める
pojedyncza koliście zamknięta cząsteczka DNA
jaka długość ma DNA E. coli
学び始める
4.6 miliona par zasad
W co jest upakowane DNA E. coli
学び始める
w nukleoid
jakie stężenie ma nukleoid E. coli
学び始める
(duże) 30-50 mg*ml-1
z ilu domen składa się nukleoid E. coli
学び始める
50-100 domen
kształt nukleidu e. coli
学び始める
domeny przytwierdzone do białka przytwierdzonego do błony komórkowej widok gwiazdy
Chromosom E. coli całościowo jest jaki?
学び始める
Superhelikalny ∆Lk? Ln(n) =0.06
Co niepozwala rotować się DNA E. coli
学び始める
Przyłaczenie DNA do białkowo-błonowego rusztowania
Najczęstsze białka wiążące DNA?
学び始める
HU i H-NS
Białko HU jest?
学び始める
-małe; zasadowe; z ładunkiem dodatnim; w postaci dimeru
jak białko HU wiąże DNA?
学び始める
Wiąże owijając wokół własnej cząsteczki
Inna nazwa białka H-NS
学び始める
wcześniejsza nazwa białko H1
Białko H-NS jest?
学び始める
monomerem; ma obojętny ładunek;
Białko H-NS preferuje wiązanie się z DNA jakim?
学び始める
Niespecyficznym przede wszystkim miejsca zagięć helisy DNA
Angielska nazwa H-NS oraz HU (zwyczajowa)
学び始める
Białko podobne do histonów - Histone-like proteins
na co ma wpływ białka H-NS oraz HU
学び始める
na kondensacje DNA
Do czego jest potrzebna kondensacja DNA
学び始める
Jest niezbędna by upakować DNA w nukleotyd i utrzymaniu struktury superhelikalnej chromosomu
co znaczy ∆Lk/Lk(-3)
学び始める
ze mamy jeden skręt superhelikalny na każde 17 skrętów helisy, w tym połowa skrętów jest wymuszona przez trwałe owiniecie wokół białek HU
inne ważne czynniki w organizowaniu domen DNA
学び始める
białka, RNA, mRNA, polimeraza RNA
homolog białka HU?
学び始める
białka IHF (integration host factor- integralny czynnik gospodarza)
Ile razy genom prokariota może być mniejszy od genomu eukariota
学び始める
Tysiące
DNA eukariota jest upakowany między innymi?
学び始める
w chromosomach
Ile chromosomów ma człowiek
学び始める
46
jaką ma długość DNA w chromosomach
学び始める
około kilku cm liniowej cząsteczki
jak wielkie jest jądro Eukariota
学び始める
zbliżone do wielkości bakterii
Jak duże stężenie DNA może być
学び始める
nawet 200 mg*ml(-1)
Co to chromatyna
学び始める
to kompleks DNA i białek (kompleks nukleoproteinowy) tworzący stopień upakowania DNA
ile procent masy chromatyny to białko
学び始める
50%
w jakiej fazie najbardziej jest skondensowany chromosom
学び始める
w metafazie
w jakiej fazie chromosom jest mocno rozproszony
学び始める
w interfazie
Co to histon
学び始める
to białka wchodzące w skład chromatyny
na jakie klasy dzielimy histony?
学び始める
H2A, H2B, H3 i H4 to histony rdzeniowe oraz H1
co to histony rdzeniowe
学び始める
to histon klasy H2A, H2B, H3 i H4
jakie są histony rdzeniowe w porównaniu do H1
学び始める
małe białka(mniejsze niż H1), mają masę od 10 do 20 kDa
histony są
学び始める
mocno dodatnie ładunkiem (ułatwia to silne wiązania z ujemnym DNA), 20 do 30% to zasadowe aminokwasy lizyna oraz arganina
jaką masę mają histony H1
学び始める
23 kDa
ilość histonów H1 jest mniej więcej połowa ilości innych histonów
学び始める
ilość histonów H1 jest mniej więcej połowa ilości innych histonów
Nukeaza to?
学び始める
Enzym hydrolizujący wiązanie fosfodiestrowe w kwasach nukleinowych
Egzonukleazy uwalniają?
学び始める
pojedyńczę nukleotydy z końców nici kwasów nukleinowych
Endonukleazy rozcinają?
学び始める
rozcinają wnętrza wiązań fosfodiestrowych
Co powoduje potraktowanie chromatyny nukleazą z mikrokoków?
学び始める
Powoduje do izolacji fragmentu DNA o różnej wielkości będącą wielokrotnością około 200 pz.
200 pz jest z czym zasocjowane
学び始める
jest zasocjowane histonowym rdzeniem (okręcone wokół rdzenia) z histonów H2a, H2B, H3 i H4 czyli histonów rdzeniowych
Po pierwszym wycięciu chromatyny nukleazą z mikrokoków i pozostawieniu w dalszym trawieniu nukleazą co się stanie
学び始める
zostanie struktura zawierająca fragment 146 pz która jest silnie zasocjowana z histonowym oktamerem (histonami rdzeniowymi) wykazuje ona podobieństwo strukturalne niezależnie od miejsca z którego została wycięta
na histonowym rdzeniu oktamerowym mamy ile pz
学び始める
mamy 146 pz owijające się 1.8 lewoskrętnego zwoju tworząc superhelikalność
Co to nukleosom
学び始める
nukleosom to rdzeń histonowy (oktamerowy) z nawiniętym DNA w 1.8 skrętu czyli z 146 pz
H1 gdzie się przyczepia?
学び始める
Przyczepia się do nukleosomu stabilizując miejsce wejścia oraz wyjścia DNA nawijając 20 pz co daje ładnie 166 pz
Czemu odpowiada 166 pz nawiniętych na rdzeń nukleosomu oraz na histon H1
学び始める
odpowiada 2 pełnym skrętom
Czemu H1 jest większe?
学び始める
bo ma dodatkowy ogon "C-końcowy" który odpowiada za stabilność DNA pomiędzy nukleosomami
Czy histon H1 może być zamieniony na inny?
学び始める
W niektórych typach komórek może być zamieniony na swój skrajny wariant na histon H5 który nie ulega transkrypcji.
Co to sznur koralików?
学び始める
to nukleosony wraz z DNA łacznikowym które jest cienką nicią DNA która uzupełnia do 200 pz powtarzających się podczas doświadczenia z nukleazą
ule wynosi standardowo DNA łącznikowe?
学び始める
Zwykle około 55pz ale może mieć od kilku do nawet 100 pz
czy histon H1 zwiększa organizacje "koralików"?
学び始める
Tak wraz z wzrostem stężenia soli aż do powstania włókien średnicy 30nm
Jak nazywa się lewostronna zawinięta helisa wyższego rzędu?
学び始める
jest to solenoid
na jeden obrót w solenoidzie przypada ile nukleosomów?
学び始める
6 nukleosomów
Długość DNA w pętli eukariota to?
学び始める
100 pz w przybliżeniu tyle co u prokariota jednak w chromosomie eukariotycznym mamy znacznie więcej pętli
przez co są końce pętli unieruchomione?
学び始める
są unieruchomione przez rusztowanie białkowe lub matriks jądrowy (czyli kompleksy białkowe)
Jak wyglądają wymiary wyższych struktur uporządkowania DNA?
学び始める
tworzą się włókna o średnicy 30 nm oraz z nich pętle o szerokości 300nm
w jakiej fazie chromosom jest najbardziej skondensowany?
学び始める
w mitozie
przed czym chroni chromosom duże skondensowanie?
学び始める
Przed rozerwaniem DNA
Przez co są rozdzielane chromosomy?
学び始める
Przez wrzeciono mitotyczne.
Co mamy na końcach chromosomów oraz DNA
学び始める
Telomery
Centromer to
学び始める
Ograniczony rejon gdzie łącza się dwie chromatydy siostrzane tworząc chromosom
co to kinetochor
学び始める
kompleks białkowy przyłączający się do mikrotubul wrzeciona mitotycznego
Co rozdzielają mikrotubule
学び始める
Rozdzielają chromatydy podczas anafazy
długość centromeru u drożdży?
学び始める
88pz bogatych w AT
Centromer Eukariota ograniczony jest
学び始める
satelitarnym DNA (sekwencjami powtarzającymi się)
Co zawiera telomer?
学び始める
zawiera setki kopi sekfencji (5-TTAGGG-3 u człowieka)
Co syntetyzuje telomeraza
学び始める
sekfencje (5-TTAGGG-3)
co to telomeraza?
学び始める
jest to rodzaj rybonukleoproteiny
Co zabezpiecza telomer
学び始める
końcówkę chromosomu
Jak uchronić telomer przed skracaniem?
学び始める
należy syntetyzować niezależnie telomer
co zachodzi podczas interfazy
学び始める
transkrypcja genów na chromosomach oraz replikacja DNA
jak długo trwa faza S (interfaza)
学び始める
większość czasu
jaką strukturę przyjmują chromosomy podczas interfazy?
学び始める
przyjmują strukturę bardziej rozproszoną nie da się ich rozróżnić
co to heterohromatyna
学び始める
jest to część chromatyny w interfazie jaka dalej jest mocno skondensowana jednak nie aż tak silnie jak w metafazie
z czego składa się heterochromatyna
学び始める
z satelitarnego DNA jest transkrypcyjnie nieaktywna przykładem jest chromosom X u samic ssaków.
gdzie widzimy heterochromatynę w jądrze pod mikroskopem
学び始める
widzimy ją na obrzeżach jądra jako ciemne prążki
Co to Euchromatyna
学び始める
pozostała część chromatyny inna niż heterochromatyna
Co się dzieje z Euchromatyną aktywną transkrypcyjnie
学び始める
może być bardziej rozproszona już rozwinięta z pętli 30nm aż do sznura koralików czy nawet odwinięta z nukleosomów by łatwo przyłączać czynniki transkrypcyjne
Jaka cześć euchromatyny jest aktywna transkrypcyjnie?
学び始める
10%
gdzie znajduje się gen?
学び始める
w miejscach aktywnych transkrypcyjnie
jak mapuje się miejsca aktywne transkrypcyjnie?
学び始める
szuka się miejsc z nadwrazliwościa na DNazę I czyli deoksyrybonukleazę I
Co robi DNaza I
学び始める
rozcina DNA
sygnał do odpowiedniego poziomu upakowania chromosomu w miejscach genów ulegających ekspresji jest?
学び始める
metylacja C-5 cytozyny występująca w sekfencji 5-CG-3
powszechnie nazwa metylacji C - 5 cytozyny?
学び始める
metylacja CpG
gdzie znajdują się niezmetylowane wyspy CpG?
学び始める
W obrębie genów aktywnych transkrypcyjnie
Jak długie są niezmetylowane wyspy CpG?
学び始める
2000 pz
co się dzieje z zmetylowaną sekwencją CpG?
学び始める
szybko mutuje do TpG z powodu spontanicznej deaminacji 5'-metylocytozyny do tyminy
przykład występowania histonu H5?
学び始める
w krwinkach czerwonych ptaków
aktywnej transkrypcji chromatyny towazyszy
学び始める
acetylacja reszty lizyny w N-końcowych domenach
co towarzyszy kondensacji chromosomów?
学び始める
fosforylacja histonu H1
unikatowe sekwencje DNA
学び始める
hybrydyzują wolniej, są często aktywne transkrypcyjnie
tandemowe zespoły genów
学び始める
to takie jakie maja sekwencje transkrypcyjną wielokrotnie powtórzona. np geny transkrybujące RNA czy DNA
sekwencje SINES
学び始める
krótkie elementy rozproszone od kilkuset pz
sekwencje LINES
学び始める
od tysiąca do 5 tysięcy pz (długie elementy rozproszone
najpopularniejsze LINES u człowieka
学び始める
sekfencja Alu
długość sekwencji Alu?
学び始める
300pz
jak często występuje Alu?
学び始める
300000 a 500000 razy się powtarza z 80% 90% procentową powtarzalnością
długość DNA satelitarnego?
学び始める
od 2 do 20-30 pz
podział DNA sateliarnego?
学び始める
minisatelity oraz mikrosatelity
minisatelity
学び始める
tandemowe powtórzenia o zmiennej liczbie powtórzeń VNTR
mikrosatelity
学び始める
proste powtórzenia tandemowe STR
gdzie znajdziemy minisatelity VNRT
学び始める
najczęściej w pobliżu końca chromosomów
Gdzie znajdziemy mikrosatelity? (SRT)
学び始める
wzdłuż całego chromosomu
do czego stosujemy minisatelity
学び始める
do zbadania odcisku DNA np w celu sprawdzeniu pokrewieństwa
sekwencja polimorficzna
学び始める
to sekwencja inna niż na chromosomie homologicznym lub jeśli występuje inna sekwencja niż standardowa u danego gatunku
SNP
学び始める
polimorfizm pojedynczych nukleotydów
SSLP
学び始める
polimorfizm długości pojedynczej sekwencji
RFLP
学び始める
polimorfizm długości fragmentów restrykcyjnych
dogmat biologii molekularnej
学び始める
Z DNA powstaje RNA które tworzy białka
polimeraza RNA co robi
学び始める
transkrybuje gen poczynając od promotora a kończąc na terminatorowej sekwencji
RNA kodujący kilka białek to
学び始める
RNA polistronicowy
translacja RNA na białko odbywa się w?
学び始める
rybosomach
miejsce RNA gdzie koduje kilka białek nazywane jest?
学び始める
Operonem
RNA jakie jest tłumaczone w Rybosomach to
学び始める
mRNA (messege RNA)
kodon startu to
学び始める
kodon inicjatorowy zwykle AUG
tRNA mają funkcje?
学び始める
transportują aminokwasy do rybosomów w celu tworzenia białek (tRNA - transport RNA)
jak wygląda ekspresja genów u prokariota
学び始める
polimeraza RNA transkrybuje gen następnie przez transkrypcje mRNA i przenoszony do rybosomu tam udział tRNA które donosi aminokwasy. Zwykle sekfencja kodonu inicjatora to AUG przy końcu 5' a terminator jest na końcu 3'
pre-mRNA
学び始める
RNA jakie jest transkrybowane w jądrze komórkowym i syntetyzowane przez polimeraze II
pre - mRNA jest transkrybowane przez którą po
学び始める
polimeraze II
zwykle u eukariota jest kodowane tylko jedno białko
学び始める
miejsca transkrypcyjne są monostronicowe
kapowanie
学び始める
czyli dodanie do pre-mRNA ogonu poli (A) na końcu 3' co zwiększa stabilność
introny
学び始める
sekwencję przerywające kodowanie białka
splicing
学び始める
usuwanie intronów z pre-mRNA i powstanie eksonów
snRNA
学び始める
małe jąderkowe RNA
snRNA powstaje?
学び始める
w wyniku splicingu

コメントを投稿するにはログインする必要があります。