|
質問 |
答え |
|
学び始める
|
|
na chr. ojcowskim, upośledzenie umysłowe, zanurzenia zachowania, zaburzenia wzrostu
|
|
|
|
学び始める
|
|
chr. matki, drżenie kończyn zab. równowagi i mowy, pogodne usposobienie
|
|
|
co ulega metylacji w DNA? 学び始める
|
|
cytozyna - powstaje 5-metylocytozyna
|
|
|
jaki substrat do metylacji DNA? 学び始める
|
|
|
|
|
Jaki enzym przeporwadza rekację metylacji? 学び始める
|
|
metylotransferaz DNA (DNMT)
|
|
|
W obrębie jaki dinukleotydów zachodzi metylacja? 学び始める
|
|
CpG (wiązanie na tej samej nici), jest ich ok. 3*10^7
|
|
|
|
学び始める
|
|
regiony DNA bogate w CpG, powyżej 200pz, gdzie C i G >/= 50%, jest ich około 29tys
|
|
|
Czy wyspy CpG są metylowane? 学び始める
|
|
|
|
|
Jaki jest stosunek zmetylowanych do nie zmetylowanych 学び始める
|
|
|
|
|
jaki jest % podział wysp do rozproszonych CpG 学び始める
|
|
|
|
|
|
学び始める
|
|
48% reg. promotorowe, 27% miedzy genami, 25% w obrębie genów, 10% metylowane
|
|
|
Gdzie są najczęsciej niezmetylowane CpG, a gdzie mogą 学び始める
|
|
niezmet. w promotorach (house-keeping gene), mogą byc zmet w genach specyficznych
|
|
|
|
学び始める
|
|
|
|
|
Czym jest metylacja zachowawcza? 学び始める
|
|
przywróceniem wzoru metylacji nici rodzicielskiej po replikacji DNA
|
|
|
|
学び始める
|
|
nowe wprowadzenie grup metylowych
|
|
|
|
学び始める
|
|
główna metylotransferaza, metylacja zachowawcza, duże powi. do hemimetylowanych CpG, kotre sa generowane w replikacji
|
|
|
|
学び始める
|
|
metylotransferaza RNA, podobna strukt. do DNTM1, ale nie metyluje DNA
|
|
|
|
学び始める
|
|
metylacja de novo, ustalanie wzorów metylacjiw początkowych stadiach rozwoju
|
|
|
|
学び始める
|
|
brak zdolności katalitycznej, czynnik stymulujący DNMT3a i b. ułatwia wiąanie SAM i DNA, zangażowana w remodelowanie chr, i deacetylacje his.
|
|
|
Wyciszanie przez metylacje, jak? 学び始める
|
|
1. zablokowanie oddziaływania metylowanych z cz. transkrypcyjnymi 2. przyłączenie do 5met. cytozyny białek MBP - wiążą też HDAC i białka ATP zalezne (pakowanie chr.)
|
|
|
|
学び始める
|
|
represja gen, piętnowanie gen, inaktywacja X, wyciszenie transpozonów, i sek. retrovir, naprawa DNA, utrzymanie stabinlości gen i strukt. chr
|
|
|
|
学び始める
|
|
brak aktywności DNMT1 - przenoszone 5mC w trakcie podziału
|
|
|
|
学び始める
|
|
bezpośrednie usuwanie 5mC przez demetylazy (nie oznaczono jescz), wycięcie 5mC przez glikozylacje i naprawa BER (wyc, niepr, zasady), przekształcenie %mC w tyminę (bAID/APOBEC) i naprawa BER, białka TET - 5mC w 5hmC
|
|
|
Główna droga demetylacji? 学び始める
|
|
|
|
|
|
学び始める
|
|
TET 1 - w ALM translokacja TET zna metylotrasferazę histonów - powstaje MLL
|
|
|
|
学び始める
|
|
u człowieka: TET1/2/3, są dioksygenazami zależnymi od Fe2+ i a-ketoglutaranu,
|
|
|
Jak wygląda szlak przekształcania przez TET? 学び始める
|
|
5mC do 5hmc, potem do 5formyloC, potem do 5karboksyC, następnie naprawa BER
|
|
|
hierarachiczna struktura chromatyny 学び始める
|
|
2nm -nagieDNA, 11nm-nukleosom, 30-solenoid, 300-wypętlona nić, 1400nm-chr. mitotyczny
|
|
|
|
学び始める
|
|
małe, stosunek. wag.z. DNA - 1:1, mała mas. cz, ptk. izoelek.-10-11, lack. tryptofan, aa. zas-22%, aa.kw.-15%
|
|
|
|
学び始める
|
|
oktamer (dimery H2A, H2B, H3, H4 - rdzeniowe), H1- łącnikowy
|
|
|
Jakie fragmenty histonów ulegają modyfikacjom? 学び始める
|
|
N-terminalne (wystają poza oktamer)
|
|
|
|
学び始める
|
|
Acetylacja, Metylacja, Fosforylacja, Ubikwitynacja, ADP-rybozylacja, Sumoilacja, Propionylacja, Biotynylacja, o-GlcNAcylacja
|
|
|
Jakie enzymy odpowiadają za acetylacje histo? 学び始める
|
|
acetylotransferazy histonów (HAT), donorem jest acetylo-CoA, proces odwracalny
|
|
|
Jakie enzymy przeprowadzają deacetylację? 学び始める
|
|
|
|
|
Jaki mechnizm odpowiada za kondensowanie chromatyny? 学び始める
|
|
acetolizyny mają ładunek obojętny, dlatego nie dochodzi od oddziaływań elektrostatycznych, tak jak w przypadku samej lizyny (kondensacja_
|
|
|
|
学び始める
|
|
1. miejscem przyłączenia białek reg. rozpoznających acetolizynę 2.
|
|
|
Jakie f-kcje ogrywa acetylacja histo? 学び始める
|
|
regulacja replikacji DNA, transkrypcji, naprawa chromatyny przez przebudowę
|
|
|
|
学び始める
|
|
GNAT, MYST (MOZ, Sas2, Sas3, Tip60), CBP/p300
|
|
|
|
学び始める
|
|
Ściśle związana z aktywacją transkrypcji genów (np. Hat1)
|
|
|
|
学び始める
|
|
Aktywacja transkrypcji i naprawa DNA
|
|
|
Czy HAT działają niezależnie? 学び始める
|
|
Nie, wchodzą w skład kompleksów takich jak SAGA, ADA (drożdże), czy TFTC - człowiek
|
|
|
Deacetylazy (HDAC) klasa1, za co odpowiadają? 学び始める
|
|
HDAC (1,2,3,8), głównie jądrze kom. w wielu tkankach i ninikach kom.
|
|
|
