Utlenianie i wogole

co to za cząsteczka?

ATP

Co to za wiązanie

estrowe

Co to za wiązanie

Bezwodnikowe

Związki fosforanowe o bardzo wysokiej energii

1,3-bis-fosfoglicerynian, fosfoenolopirogronian, fosfokreatyna; Uczestniczą w syntezie ATP na drodze FOSFORYLACJI SUBSTRATOWEJ

Związki fosforanowe o wysokiej energii

ATP oraz inne trójfosforany nukleotydów

Wiązanie tioestrowe

Występuje między siarką koenzymu A, a grupą karbonylową kwasu organicznego. (np. Acetylo-CoA włączające się do cyklu Krebsa). Jest to wiązanie wysokoenergetyczne

Jak erytrocyty czerpią energię

glikoliza beztlenowa i fosforylacja substratowa fosfoenolopirogronianu i 1,3-bis-fosfoglicerynianu

Co to za związek chemiczny?

1,3-bis-fosfoglicerynian - wysokoenergetyczny związek z wiązaniem acylofosforanowym

Które wiązanie jest wiązaniem wysokoenergetycznym?

1

Co to za związek chemiczny?

Fosfoenolopirogronian - wysokoenergetyczny związek z wiązaniem enolofosforanowym

Co to za związek chemiczny?

fosfokreatyna - związek wysokoenergewtyczny

Kolejność przenośników oksydoredukcyjnych w łańcuchu oddechowym

NAD -> FMN -> CoQ -> cyt. b -> cytc. 1 -> cyt. c -> cyt.(aa3) -> O2

Potencjał oksydoredukcyjny kolejnych przenośników łańcucha oddechowego rośnie, czy maleje?

rośnie

Czego inhibitorami jest amytal i rotenon

Transportu elektronów z FMN na CoQ w łańcuchu oddechowym

Jaki enzym jest wspólny dla cyklu Krebsa i łańcucha oddechowego

dehydrogenaza bursztynianowa

Do czego jest potrzebny GTP?

inicjacji translacji, w preocesie replikacji i transkrypcji

czego inhibitorem jest antymycyna

Transportu elektronów z cyt. b na cyt. c w łańcuchu oddechowym

czego inhibitorem jest CN-, azydki, H2S i CO?

transportu elektronów z cyt a+a3 na tlen

reakcja katalizowana przez kinazę adenylanową

ATP + AMP -> 2ADP

Kompleks I łańcucha oddechowego

dehydrogenaza NADH zawierająca wbudowaną cząsteczkę FMN, która przenosi atomy wodoru na ubichinon (CoQ), wpompowując 4H+ do przestrzeni międzybłonowej. Zawiera białka FeS

jakie składniki łańcucha oddechowego są ruchliwe?

CoQ (ubichinon) i cytochrom c

Kompleks III łańcucha oddechowego

oksydoreduktaza ubichinol: utleniony cyt.c. Zawiera cytochrom b, c1 i białka FeS. Transportuje elektrony z CoQ, poprzez cytochrom b, c1 na cytochrom c. zawiera białka FeS. Wpompowuje 4 H+ do przestrzeni międzybłonowej

Kompleks IV łańcucha oddechowego

oksydaza cyt. c / oksydaza cytochromowa. Transportuje elektrony ze zredukowanego cytochromu c poprzez cyt. a i cyt. a3 na tlen. Wpompowane zostaje 2H+. Nie posiada białek FeS

Kompleks II łańcucha oddechowego

dehydrogenaza bursztynianowa, białka FeS i FAD. Utlenia bursztynian do fumaranu, uzyskując elektrony, które przesyła poprzez FAD na CoQ (ubichinon). Nie wpompowuje H+ do przestrzeni międzybłonowej

Kompleks V łańcucha oddechowego

syntaza ATP. Składa się z domeny Fo wbudowanej w błonę i domeny F1 skierowanej do macierzy. wykorzystuje gradient protonów do syntezy ATP z ADP i Pi, przepuszczając je z przestrzeni międzybłonowej do macierzy

które kompleksy łańcucha oddechowego spełniają funkcję pompy protonowej

I, III, IV

Za ile wpompowanych H+ i wyprodukowanych ATP odpowiada NADH, a ile FADH2?

NADH - 10H+, 3 ATP; FADH2 - 6H+, 2ATP

z jakich podjednostek zbudowane są domeny Fo i F1 syntazy ATP

Fo: 1 podjednostka a, 2b i 9-12c; F1: 3alfa, 2beta i 1gamma, 1 delta i 1 epsilon

Źródła acetylo-CoA

glikoliza cukrów prostych, a następnie dekarboksylacja oksydacyjna powstałego pirogronianu, beta oksydacja kwasów tłuszczowych, deaminacja i oksydacja aminokwasów

W co może być przekształcany pirogronian?

Acetylo-CoA, Szczawiooctan (te 2 najważniejsze), a także mleczan i alanina

Kofaktory kompleksu dehydrogenazy pirogronianowej

(The Love Can Fly Naturally) Tiaminy pirofosforan, liponian, CoA, FAD, NAD+

Acetylo-CoA powstaje z pirogronianu, a czy może powtać pirogronian z Acetylo-CoA?

Nie (mieliśmy to zapamiętać z jakiegos powodu)

Czym jest rozprzężenie fosforylacji oksydacyjnej i co ją powoduje?

"Zahamowanie" (w zadaniach nie jest traktowane jako zahamowanie) fosforylacji oksydacyjnej bez zahamowania transportu łańcucha oddechowego. 2,4-dinitrofenol, dikumarol, duże stężenie tyroksyny (T4) i duże dawki salicanów (aspiryny)

Który cytochrom jest jedynym rozpuszczalnym w wodzie?

cytochrom c

Który z elementów łańcucha oddechowego nie jest białkiem

ubichinon CoQ

Jakie związki hamują syntazę ATP?

oligomycyna, atraktylozyd

Co zmniejsza aktywność dehydrogenazy pirogronianowej

Defosforylacja reszt serylowych, wzrost stosunku ATP: ADP, acetylo~S-CoA: CoA-SH, NADH: NAD+ (produktów do substratów)

Z jakich enzymów składa siękompleks dehydrogenazy pirogronianowej

dehydrogenaza pirogronianowa, transacetylaza dihydrolipoilowej, dehydrogenaza dihydrolipoilowa

Reakcja pomostowa (oksydacyjna dekarboksylacja pirogronianu)

pirogronian + NAD+ + CoA -> Acetylo-CoA + NADH + H+ + CO2

Pierwszy etap cyklu Krebsa

Kondensacja reszty acetylowej pochodzącej z acetylo-CoA ze szczawiooctanem, dzięki czemu powstaje cytrynian. Enzym katalizujący reakcję: syntaza cytrynianowa

Co hamuje syntazę cytrynianową?

ATP, NADH, sukcynylo~S-CoA, cytrynian

Drugi etap cyklu Krebsa

Izomeryzacja cytrynianu do izocytrynianu. Enzymem reakcji jest Akonitaza, która potrzebuje jonów Fe2+ (Hamuje ją monofluorocytrynian powstały wskutek sprzężenia szczawiooctanu z monofluorooctanem przez syntazę cytrynianową). Reakcja odwracalna

Trzeci etap cyklu Krebsa

Utlenianie i dekarboksylacja izocytrynianu do alfa-ketoglutaranu. W wyniku przemiany powstaje CO2 i NADH+H+

Regulacja utleniania i dekarboksylacji izocytrynianu

Aktywowany przez ADP i Ca2+, a hamowany przez ATP i NADH

Czwarty etap cyklu Krebsa

Oksydacyjna dekarboksylacja alfa-ketoglutaranu do bursztynylo-CoA. Jest katalizowana przez dehydrogenazę alfa-ketoglutaranową z kofaktorami tymi co w reakcji pomostowej. Powstaje CO2 i NADH+H+

Regulacja oksydacyjnej dekarboksylacji alfa-ketoglutaranu

aktywacja: Ca2+, NAD+, AMP, CoA hamowanie: ATP, GTP, NADH, Bursztynylo~S-CoA

Podczas jakiej reakcji cyklu Krebsa zachodzi fosforylacja substratowa?

rozpad bursztynylo~S-CoA

Piąty etap cyklu Krebsa

Rozpad bursztynylo~S-CoA do bursztynianu przy udziale syntetazy sukcynylo-CoA. Powstaje ATP/GTP (GTP w miejscach gdzie zachodzi glukoneogeneza - w wątrobie i nerkach a w pozostałych ATP). Reakcja odwracalna

Szósty etap cyklu Krebsa

ZACHODZI NA WEW. BŁ. Utlenianie bursztynianu przez dehydrogenazę bursztynianową do fumaranu. Powstaje FADH2. Reakcja odwracalna

przedostatni/siódmy etap cyklu Krebsa

Hydratacja fumaranu do L-jabłczanu przez fumarazę. W reakcji potrzebna cząteczka wody jako substrat. Reakcja odwracalna

ostatni/ósmy etap cyklu Krebsa

Utlenianie jabłczanu przez dehydrogenazę jabłczanową do szczawiooctanu. Powstaje 1 cz. NADH. Jest odwracalna i w teorii równowaga reakcji jest skierowana w stronę jabłczanu, ale w praktyce i tak powstaje szczawiooctan.

Co jest inhibitorem kompetecyjnym dehydrogenazy bursztynianowej?

malonian

Podczas których reakcji cyklu Krebsa jest wydzielany CO2?

Utelnianie i dekarboksylacja izocytrynianu, oksydacyjna dekarboksylacja alfa-ketoglutaranu

podczas jakich reakcji cyklu Krebsa powstaje NADH lub FAD?

NADH: utlenianie i dekarboksylacja izocytrynianu, oksydacyjna dekarboksylacja alfa-ketoglutaranu, utlenianie jabłczanu FADH2: Utlenianie bursztynianu

Bilans energetyczny cyklu Krebsa

3 NADH, FADH2, ATP/GTP = 3x3 + 2 + 1 = 15 ATP

Czy błona wewnętrzna mitochondrium jest przepuszczalna dla NADH?

NIE - stąd mostek glicerolofosforanowy i jabłczanowo-asparaginowy, które umożliwiają zużycie NADH powstałego podczas glikolizy w cytosolu w łańcuchu oddechowym

Mostek glicerolofosforanowy

Dehydrogenaza glicerolo-3-fosforanowa przenosi wodór z NADH na fosfodihydroksyaceton, dzięki czemu powstaje glicerolo-3-fosforan. On odtwarzając się do fosfodihydroksyacetonu przenosi wodór na FAD kompleksu II

Jaki związek chemiczny spośród wysokoenergetycznych posiada wiązanie guanidynofosforanowe?

fosfokreatyna

Co pobudza syntazę cytrynianową?

ATP

Inna nazwa CoQ

Ubichinon

Co hamuje dehydrogenazę alfa-ketoglutaranową?

arszenik